Den genetiska variationen i Skandinavien ökade under vikingatiden för att sedan minska igen

[Småland]

[Visi]

Jägarn,

Menar du att IBD-analyser (Identical by Descent) är nytt när det gäller analyser med aDNA (ancient DNA)?

För de företag som säljer autosomala tester för genetisk genealogi har ju använt denna/påtagligt snarlik analysmetod sedan många år tillbaka.

(Kanske missförstår det du skriver?)

[Jägarn]

Jägarn,

Menar du att IBD-analyser (Identical by Descent) är nytt när det gäller analyser med aDNA (ancient DNA)?

För de företag som säljer autosomala tester för genetisk genealogi har ju använt denna/påtagligt snarlik analysmetod sedan många år tillbaka.

(Kanske missförstår det du skriver?)

Det är en metod som har börjat användas oftare vid arkeogenetiska studier sedan 2020. Det stämmer givetvis att företag som 23andMe länge använt sig av sådana metoder. Att använda sig av IBD när man analyserar en levande människans genom är dock inte samma sak som att använda sig av det vid analys av mycket dåligt bevarat, flera tusen år gammalt DNA. Här är ett bra stycke från studien jag bifogade som förklarar detta, samt hur dessa nya metoder trots det kan ta sig runt problemet på ett sätt som man tidigare inte har kunnat:

Existing methods to call IBD segments between present-day genomes cannot be straightforwardly applied to ancient DNA data (aDNA) due to typically low coverage and high genotyping error rates. We present ancIBD, a method to identify IBD segments for human aDNA data implemented as a Python package. Our approach is based on a Hidden Markov Model, using as input genotype probabilities imputed based on a modern reference panel of genomic variation. Through simulation and downsampling experiments, we demonstrate that ancIBD robustly identifies IBD segments longer than 8 centimorgan for aDNA data with at least either 0.25x average whole-genome sequencing (WGS) coverage depth or at least 1x average depth for in-solution enrichment experiments targeting a widely used aDNA SNP set (‘1240k’).

Om du kikar på äldre studier kommer du se att de istället för det mesta använder sig av qpAdm, ADMIXTURE eller DATES. Men när dessa verktyg kombineras med IBD-analys och analys av Y-DNA och mtDNA så blir resultatet väldigt robust och ger en mycket tydligare helhetsbild.

[Visi]

Tack för klargörandet Jägarn.

Hoppas det blir möjligt att ladda ner aDNA-filer i samma format som 23andMe, FTDNA etc (alltså kolumner för markör, kromosom, position och genotyp).

Så kan man leta efter längsta (antalet snp) eller "längsta" (centiMorgan, adderad info från annat håll) överlappet mellan sin egen fil och förhistoriska/historiska personers dito.

[Visi]

IBD-analyser a la FTDNA et al funkar om släktskap inte är alltför långt tillbaka.
Så att jämföra autosomala aDNA från medeltiden eller tidigare med sitt eget autosomala DNA ger nog inte alls mycket. Men man har ju testat individer som fanns på Kronan när den sjönk så i teorin skulle man definitivt kunna autosomalt DNA-matcha en passagerare.
Ville bara förtydliga mitt föregående inlägg.

[Jägarn]

@Småland, nu har en av de två stora polska studierna som kommer att publiceras detta år publicerats. Länk till studien: https://genomebiology.biomedcentral.com ... 23-03013-9
Semestern har gjort att jag inte hunnit läsa den ordentligt förrän nu, men nu har jag tagit mig en mer noggrann titt.

Denna studie har samlat DNA från individer som sträcker sig från järnålderns goter till medeltida slaver i Polen.

En stor del av individerna som testades i denna studie tillhörde Wielbarkkulturen: https://en.wikipedia.org/wiki/Wielbark_culture

Några intressanta utdrag ur studien:

Our Y-chromosome analyses revealed significant differences between the two studied groups. The patrilineal genetic structure of the IA group members was dominated by I1 Y-hg lineages. Many identified I1 clades are now the most common Y-hg in present-day Nordic populations, reaching a 28–38% frequency [75, 76]. An increased I1 Y-hg frequency was previously reported in the context of Anglo-Saxon migrations to Britain [77,78,79]. This further supports the Northern European origin of the Wielbark culture-associated people. The Y-hg I1 frequency dropped significantly in the MA group in favour of the Y-hg R1a. In the IA I1 individuals, the highest frequency was observed for the L118 mutation (41.3%), which is common in present-day Scandinavia and Finland.

Most of the collected data including f4 statistics and qpAdm models showed that the genetic makeup of the Wielbark culture-associated people was related with the ancient northern European populations including Denmark_IA and Norway_IA. This result is consistent with our earlier observation of matrilineal connections between IA_Kowalewko and the IA population from Jutland Peninsula [37]. Here, we further showed that the Wielbark culture-associated IA populations could not be derived from the preceding the EBA_Unetice populations alone. It means that the migration from northern Europe was necessary to the formation of the IA group genetic pool.

Our results highlight the prevalence of haplogroups I1/I1a during the Iron Age in the territory of contemporary Poland. These haplogroups were found to be the most frequent haplogroups in each studied location ranging from 35.3% in Pruszcz Gdański to 57.1% in Masłomęcz and totalling to 41.3% in the whole IA group. Six individuals could be assigned to a more detailed Y-chromosome haplogroup representing three different I1a clades. Two males, one from Masłomęcz (PCA0102) and one from Pruszcz Gdański (PCA0480), belonged to the I1a1 clade and were assigned as I1a1-L22 and I1a1-P109 respectively. Next, a male from Masłomęcz (PCA0100) belonged to the I1a2 clade and was assigned as I1a2-Z2040. Finally, three males all from Kowalewko belonged to the I1a3 clade and shared the same marker I1a3-L1237. The remaining lineages had the following frequencies R1b:13.0%, G2a:11.0%, R1a:8.7%, Other:6.5%, E1b:4.3%, I2a:4.3%, N1a:4.3%, J2a:2.2%, J2b:2.2%, Unk:2.2% as shown in Figure 3a.

Det är också värt att nämna att en studie som testade ett stort antal individer från bronsålderskulturerna i Polen (Trzciniec, Mierzanowicekulturen och Strzyżówkulturen) publicerades i början av Augusti. Dessa liknade inte alls Wielbarkkulturens människor (för det mesta) utan bar nästan uteslutande på Y-kromosomhaplogrupperna I2 och R1a, med undantag för två individer med R1b. På autosomerna var de väldigt lika andra grupper i Östeuropa under bronsåldern. Länk till den studien: https://www.nature.com/articles/s41467-023-40072-9

Så intressant nog var människorna i Polen under bronsåldern typiskt "balto-slaviska", till skillnad från majoriteten i Wielbarkkulturen som bestod av nykomlingar från Sydskandinavien. Föga förvånande är att de medeltida slaverna var genetiskt annorlunda jämfört med järnåldersklustret (det framgår extra tydligt i figur.2) och bar huvudsakligen på Y-kromosomhaplogrupp R1a-M458 och R1a-Z280, till skillnad från järnålderns östgermaner som hade en mycket hög frekvens av I1.

Tidigare i den här tråden var vi inne på I1-L22. De individer med L22 som hittades i Wielbarkkulturen är nu de äldsta (än så länge).

Hade Jordanes en poäng, ändå?

[Småland]

Hej jägarn
Jordanes hade nog ganska bra koll på läget, gamla sanningar blir sanna igen, jag är själv mycket tacksam att dna tekniken kom.
Har i många år läst om de olika germanska stammarna och ständigt blivit förvånad av att (weibullismen) hakat sig fast så länge bland många i sverige trots alla nyare rön.

[Jägarn]

Hej jägarn
Jordanes hade nog ganska bra koll på läget, gamla sanningar blir sanna igen, jag är själv mycket tacksam att dna tekniken kom.
Har i många år läst om de olika germanska stammarna och ständigt blivit förvånad av att (weibullismen) hakat sig fast så länge bland många i sverige trots alla nyare rön.

Det håller jag helt med dig om.

Det är skönt att vi nu kan begrava envisa diffusionistiska idéer om att domarringarna och skeppssättningarna i Wielbarkkulturen bara var ett resultat av att lokalborna i Polen under järnåldern en dag vaknade upp och kände att de hemskt gärna ville härma dessa typiskt skandinaviska fenomen.

[Jerrark]

Det är intressant att konstatera att kontakter mellan Norden och nuvarande Polen kan ses redan under bronsåldern. 2013 kom en avhandling som visade att åtminstone en nordbo mötte sitt öde därnere.

Bevis för utvandring från Sverige till Polen under tidig bronsålder

Under den tidiga bronsåldern var befolkningen mycket rörlig i Úneticekulturen i Silesia, de sydvästliga landområdena i Polen. Det visar en ny avhandling i arkeologi från Göteborgs universitet, som också bekräftar en långväga resa för snart 4 000 år sedan över havet från Skandinavien till Silesia, troligen från södra Sverige. För över 3 800 år sedan reste en ung man, möjligen född i Skåne, över 90 mil söderut till Wroclaw i Polen. Där mötte han en våldsam död när han slogs ihjäl av bönder från Úneticekulturen, kanske på grund av en romans med två lokala kvinnor, som mördades tillsammans med honom. Denna ”kärlekshistoria från bronsåldern” utan lyckligt slut är det första beviset av svensk-polska kontakter i historien någonsin, säger arkeologen Dalia Pokutta, som skrivit avhandlingen.

https://www.forskning.se/2013/09/23/bev ... ronsalder/

Dalia Pokuttas avhandling heter Population Dynamics, Diet and Migrations of the Unetice Culture in Poland och den gavs ut på Göteborgs universitet.

Mer om avhandlingen
https://su.diva-portal.org/smash/record ... &dswid=652

[Småland]

Hej jägarn har det kommit några nyarön på sistone?